Skip to Content

Instrukcja korzystania z Biblioteki

Serwisy:

Ukryty Internet | Wyszukiwarki specjalistyczne tekstów i źródeł naukowych | Translatory online | Encyklopedie i słowniki online

Translator:

Kosmos
Astronomia Astrofizyka
Inne

Kultura
Sztuka dawna i współczesna, muzea i kolekcje

Metoda
Metodologia nauk, Matematyka, Filozofia, Miary i wagi, Pomiary

Materia
Substancje, reakcje, energia
Fizyka, chemia i inżynieria materiałowa

Człowiek
Antropologia kulturowa Socjologia Psychologia Zdrowie i medycyna

Wizje
Przewidywania Kosmologia Religie Ideologia Polityka

Ziemia
Geologia, geofizyka, geochemia, środowisko przyrodnicze

Życie
Biologia, biologia molekularna i genetyka

Cyberprzestrzeń
Technologia cyberprzestrzeni, cyberkultura, media i komunikacja

Działalność
Wiadomości | Gospodarka, biznes, zarządzanie, ekonomia

Technologie
Budownictwo, energetyka, transport, wytwarzanie, technologie informacyjne

ECO-MP: E coli-Metabolic Pathway-development of Genome-scale Metabolic Pathway Database for Escherichia coli

Reconstruction of genome-scale metabolic pathway is an essential task to understand cellular processes in Escherichia coli K-12 species. ECO-MP, an E. coli metabolic pathway database is developed for the investigation of biosynthetic pathways of metabolic network. ECO-MP database is created by BLASTing protein sequences of E. coli against KEGG database and the sequences are categorized as known pathways, unknown and constructed pathways. Further, ECO-MP directs the gene or proteins to KEGG pathway in which they involved or otherwise it is linked to generate subnetworks using chemical reactions obtained from KEGG by network expansion method. Totally 2,560 known and 1,730 unknown proteins have been annotated to facilitate metabolic pathway reconstruction in E. coli. The subnetworks obtained from ECO-MP can be employed to fill the metabolic holes or to create an alternative pathway by means of network expansion method and it can be accessed at http://ecomp.bioinfo.au-kbc.org.in/.

Trends in Bioinformatics 2014/04/27 - 19:53 Czytaj